萌娘百科创建于2010年10月11日，创始人为Baskice，是非商业ACGN主题在线百科全书。萌娘百科偏向收录女性角色、萌拟人化作品以及相关原创作品。百科中的大多数条目以萌拟人化的形式出现因为收录很多动漫术语，亦被认为是专门收集动漫术语的百科。
萌娘百科的前身为“绿坝娘wiki”，是为保存大量原创人物绿坝娘的相关内容而设立的独立网站，后更名为“中华萌娘小百科”。2011年5月1日，站点名称正式简化为萌娘百科；2013年1月8日，萌娘百科开设英文站与日文站；2021年6月8日，萌娘百科运营权由时任站长Baskice正式移交至绍兴萌派，萌娘百科自此进入公司化运作。
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